войне для уменьшения смертности и числа ампутаций Бурденко занимался проблемами сортировки раненых, скорейшей их транспортировки их до госпиталей. Под его управлением в лазаретах были организованы отделения для раненых в живот, в легкие, в череп.
Во Второй мировой войне Н.Н.Бурденко был главным хирургом Красной армии. Организовал работу по сбору оперативной информации о раненых.
Бурденко являлся основоположником советской нейрохирургии. Он известен своими теоретическими работами и совершенствованием практики и хирургической техники, которая дала ему возможность проникнуть в самые сокровенные места центральной нервной системы. Все его научные идеи не были необоснованными гипотезами, они были связаны с практикой. Он трудился и творил без отдыха, не щадя своих сил. Бурденко за свои высокие заслуги был отмечен почётным званием Героя Социалистического Труда.